國(guó)家基因庫(kù)發(fā)起“千種魚轉(zhuǎn)錄組計(jì)劃”

11月19日，深圳國(guó)家基因庫(kù)宣布“千種魚轉(zhuǎn)錄組計(jì)劃”（Fish T1K）正式啟動(dòng)。該項(xiàng)目旨在解密魚類起源、進(jìn)化、生殖、發(fā)育、性別調(diào)控和免疫等活動(dòng)機(jī)制，以更好應(yīng)對(duì)魚類育種、疾病防控、海洋食品安全和生物多樣性保護(hù)等帶來的諸多挑戰(zhàn)。項(xiàng)目計(jì)劃在未來3～5年內(nèi)完成約1000種魚類轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序、組裝工作，并構(gòu)建高質(zhì)量的魚類轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息平臺(tái)。

相對(duì)于其他魚類轉(zhuǎn)錄組研究，千種魚轉(zhuǎn)錄組計(jì)劃規(guī)模大、學(xué)科交叉廣、綜合性強(qiáng)，在范圍內(nèi)尚屬*。

該項(xiàng)目產(chǎn)出的所有數(shù)據(jù)將通過國(guó)家基因庫(kù)公開，以保證科學(xué)家可以實(shí)時(shí)掌握魚類研究動(dòng)態(tài)及RNA-seq測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用。

據(jù)介紹，到目前為止，僅有約10種魚類的基因組被公開報(bào)道。此外，在NCBI公共數(shù)據(jù)庫(kù)中僅有80多種魚類轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。

國(guó)家基因庫(kù)海洋分庫(kù)負(fù)責(zé)人、該項(xiàng)目帶頭人孫穎認(rèn)為：“T1K項(xiàng)目將建立*專門針對(duì)魚類組學(xué)研究的性合作網(wǎng)絡(luò)，并將大大深化我們對(duì)魚類的比較生理學(xué)、生物地理學(xué)認(rèn)識(shí)，促進(jìn)魚類資源醫(yī)用價(jià)值的挖掘、經(jīng)濟(jì)和生態(tài)價(jià)值的開發(fā)，以及生物多樣性保護(hù)等問題的解決。”

《中國(guó)科學(xué)報(bào)》 （2013-11-21 第1版 要聞）